Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssc5dQ8BV57 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms