Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTW9

Pak4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak4Q8BTW9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pak4Q8BTW9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pak4Q8BTW9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms