Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gga3Q8BMI3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms