Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zcchc4Q8BKW4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zcchc4Q8BKW4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms