Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy1Q8BIJ7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy1Q8BIJ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms