Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Vipas39Q8BGQ1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Vipas39Q8BGQ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Vipas39Q8BGQ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Vipas39Q8BGQ1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Vipas39Q8BGQ1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Vipas39Q8BGQ1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Vipas39Q8BGQ1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Vipas39Q8BGQ1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Vipas39Q8BGQ1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms