Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms