Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Best2Q8BGM5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Best2Q8BGM5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms