Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmtc4Q8BG19 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmtc4Q8BG19 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms