Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg4cQ811C2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Atg4cQ811C2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Atg4cQ811C2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Atg4cQ811C2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg4cQ811C2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg4cQ811C2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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