Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc172Q810N9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms