Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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