Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cracr2bQ80ZJ8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cracr2bQ80ZJ8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms