Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Amigo1Q80ZD8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Amigo1Q80ZD8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms