Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc28Q80XJ3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc28Q80XJ3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc28Q80XJ3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc28Q80XJ3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ttc28Q80XJ3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc28Q80XJ3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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