Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrde2Q80XC6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrde2Q80XC6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms