Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cep170bQ80U49 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep170bQ80U49 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms