Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl29Q80T74 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms