Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc42bpbQ7TT50 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc42bpbQ7TT50 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc42bpbQ7TT50 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc42bpbQ7TT50 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdc42bpbQ7TT50 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdc42bpbQ7TT50 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdc42bpbQ7TT50 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdc42bpbQ7TT50 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms