Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgo2Q7TSY8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms