Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms