Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2q1Q7TSS2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2q1Q7TSS2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms