Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clec18aQ7TSQ1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec18aQ7TSQ1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms