Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms