Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mycbp2Q7TPH6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms