Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nphp3Q7TNH6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nphp3Q7TNH6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms