Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd1l2Q7TN88 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkd1l2Q7TN88 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms