Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SyncripQ7TMK9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms