Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpv1Q704Y3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpv1Q704Y3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms