Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ino80Q6ZPV2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms