Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smpd4Q6ZPR5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms