Protein–RNA interactions for Protein: Q6YI28

2210407C18Rik, EP1, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210407C18RikQ6YI28 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2210407C18RikQ6YI28 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms