Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms