Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scgb2b2Q6UGQ3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scgb2b2Q6UGQ3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms