Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja6Q6S5G4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja6Q6S5G4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms