Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab35Q6PHN9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms