Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc57Q6PHN1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc57Q6PHN1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms