Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGN3

Dclk2, Serine/threonine-protein kinase DCLK2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk2Q6PGN3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dclk2Q6PGN3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dclk2Q6PGN3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms