Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Znf316Q6PGE4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf316Q6PGE4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf316Q6PGE4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms