Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc36Q6PDM4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms