Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rundc3bQ6PDC0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc3bQ6PDC0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms