Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RgmaQ6PCX7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RgmaQ6PCX7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms