Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gapvd1Q6PAR5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Gapvd1Q6PAR5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gapvd1Q6PAR5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gapvd1Q6PAR5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms