Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp49Q6P9L4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp49Q6P9L4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms