Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PcnpQ6P8I4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms