Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrimpolQ6P1E7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrimpolQ6P1E7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms