Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slx4Q6P1D7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms