Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms