Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms