Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Gpbp1Q6NXH3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms